数码宝贝第二部国语版全集故事发生在第一次冒险的三年后，数码世界又随即开始出现新的危机，为此而出现了新的被选中的孩子来拯救这个世界，毕竟除了阿武和小光外，原本被选中的孩子们都进入中学，无法再长时间地守护数码世界和他们的数码兽伙伴；某日，一位自称凯撒的凶暴少年突然出现，不但攻击数码兽，还利用黑暗螺旋环和黑暗塔企图控制数码兽们，在他的处处逼迫之下，数码兽迫于无奈展开战斗。