咯咯咯的鬼太郎故事讲述的是在人类不知也无法到达的地方存在着一个妖怪世界。在眼珠老爹、猫女、子泣爷爷、砂婆婆这些朋友的保护和照顾下，鬼太郎在那个神秘的妖怪世界里开心快乐、自由自在的生活着。突然有一天，鬼太郎接到了妖怪信使带来的一封信。向他求助的是一个叫做三浦健太的小学生。健太和高中生姐姐实花和他们的父亲晴彦生活在一起。他们居住的小区为了修建主题公园，正在拆毁稻荷神社，而从动工的那天开始，每天都会出现许多形状怪异的妖怪，居住在那个小区的居民都陷入了恐慌和慌乱中。